В 1998 году при Воронежском епархиальном управлении был создан отдел по работе с вооруженными силами. С 2009 года его возглавляет священник Николай Бабич – настоятель храма во имя свт. Антония (Смирницкого), архиепископа Воронежского. Отдел взаимодействует с благочинными церковных округов, настоятелями и клириками храмов Воронежской епархии, Воронежской духовной семинарией (ВДС) и епархиальными отделами:
- по взаимодействию с правоохранительными органами;
- молодежным;
- религиозного образования и катехизации;
- миссионерским;
- издательским.

Отдел ведет работу в воинских частях и подразделениях Министерства Обороны, Министерства чрезвычайных ситуаций, Федеральной пограничной службы, Федерального агентства правительственной связи и информации, Министерства внутренних дел, военных учебных заведениях, областном и районных военных комиссариатах, находящихся на территории Воронежской епархии, в сфере патриотического и нравственного воспитания личного состава, духовного окормления, просвещения и социальной защиты военнослужащих и членов их семей, реализации их религиозных потребностей.

I. В области патриотического и нравственного воспитания личного состава, духовного окормления и просвещения военнослужащих и членов их семей проводятся следующие мероприятия:
- регулярные встречи священнослужителей с командирами, заместителями командиров по воспитательной работе воинских частей и учебных заведений, на которых обсуждаются вопросы взаимодействия и проведения совместных мероприятий;
- духовно-назидательные, просветительские, патриотические и индивидуально-пастырские беседы священнослужителей с военнослужащими;
- духовные напутствия священнослужителей с совершением молебных пений:
а) молодому пополнению воинских частей и учебных заведений в ходе проведения ритуала принятия Военной присяги;
б) военнослужащим перед отбытием в районы «горячих точек» и выполнением иных ответственных задач;
в) личному составу перед началом учебного процесса и после окончания обучения, выпускникам институтов в ходе проведения ритуала выпуска молодых офицеров;
г) военнослужащим в ходе проведения ритуала вручения оружия (освящение оружия);
- участие священнослужителей в армейских торжествах, в праздновании знаменательных дат в истории России, Вооруженных Сил, воинских частей и учебных заведений:
23 февраля - День защитников Отечества
9 мая - День Победы
28 мая - День пограничников
12 июня - День независимости России
4 октября - День гражданской обороны
10 ноября - День милиции
27 декабря - День образования МЧС и др.
- участие священнослужителей в сборах заместителей командиров по воспитательной работе, профессорско-преподавательского состава институтов по проблемам воинского и патриотического воспитания военнослужащих (Гарнизонный дом офицеров). В рамках сборов проводятся занятия с офицерами по следующим темам: «История взаимодействия Русской Православной Церкви и Российской Армии», «Сотрудничество Русской Православной Церкви и Российской Армии в современных условиях», «Православие и другие религии» (для подготовки офицерского корпуса с более широким кругозором в вопросах религиоведения), «Тоталитарные секты и опасность их проникновения в Вооруженные Силы»;
- проведение священнослужителями и преподавателями Воронежской Православной Духовной Семинарии факультативных занятий с личным составом институтов на тему «История и роль Православия» в целях изучения истории Православия в России, разъяснения основных понятий русской православной культуры, показа исторического аспекта взаимодействия армии и церкви в России, развития духовно-нравственных и патриотических качеств личности воина;
- создание в библиотеках воинских частей и учебных заведений отделов православной литературы и пополнение их духовной литературой и церковными периодическими изданиями;
- показ фильмов православного и патриотического содержания в воинских частях и учебных заведениях, обеспечение аудио- и видеоматериалами (в отделе работает электронная библиотека, прокат видео- и аудиокассет и лазерных дисков);
- организация экскурсий для военнослужащих и членов их семей по православным храмам и монастырям епархии: Алексиево-Акатов монастырь, Дивногорский монастырь и др.
- освящение вооружения, техники, казарменных помещений, учебных корпусов, госпиталей, воинских музеев, зданий управлений ГО и ЧС, зданий областного и районных военных комиссариатов.
Вышеуказанные мероприятия способствуют возрождению православных традиций российской армии, позволяют использовать духовно-нравственный потенциал Русской Православной Церкви в деле патриотического и нравственного воспитания военнослужащих и оказывают большое влияние в деле оздоровления нравственного климата в воинских коллективах, профилактики нарушений воинской дисциплины, искоренения неуставных взаимоотношений и других негативных явлений. Все это оказывает помощь командованию воинских частей в формировании морально-психологической устойчивости военнослужащих, содействует воспитанию у воинов нравственной мотивации к военной службе, способности к самоотдаче, подвигу на благо Родины.

II. Для поднятия общественного престижа ратной службы в рядах российской армии, утверждения исконного уважения к нашему доблестному воинству, воспитания у молодых людей допризывного и призывного возраста должного отношения к предстоящему им исполнению воинского долга проводятся следующие мероприятия:
- регулярные встречи священнослужителей с областным и районными военными комиссарами и их заместителями по воспитательной работе;
- духовно-патриотические беседы с призывниками, духовные напутствия призывникам перед отправкой в Вооруженные Силы Российской Федерации (с совершением молебных пений);
- участие священнослужителей в работе военных комиссариатов и заседаниях областных и районных приемных комиссий по решению текущих вопросов комплектации и духовного становления Вооруженных Сил;
- духовное окормление воспитанников кадетских корпусов г. Воронежа (Воронежский Великого князя Михаила Павловича кадетский корпус, Морской кадетский корпус «Петр Великий»).

III. В области социальной защиты военнослужащих и их семей проводятся:
- пастырские посещения раненых и больных военнослужащих, находящихся на излечении в госпиталях и лазаретах. Духовенство оказывает помощь в психологической реабилитации воинов;
- совершение для больных воинов церковных Таинств и обрядов (крещение, исповедь, соборование, причастие и др.);
- беседы священнослужителей с больными воинами и медперсоналом;
- собеседования по психологической реабилитации с военнослужащими и членами их семей при обострении проблем морально-психологического характера;
- индивидуально-пастырская воспитательная работа с военнослужащими, нарушающими воинскую дисциплину, а также имеющими отклонения от норм поведения;
- совместное проведение благотворительных акций и ритуальных мероприятий для оказания социальной, моральной и духовной поддержки ветеранам Великой Отечественной Войны и воинских частей, семьям погибших воинов;
- совершение панихид по павшим воинам в храмах, воинских частях и у братских могил погибших;
- организация летнего оздоровительного отдыха в Православном лагере «Кристалл» (пос. Дубовка) для детей из малообеспеченных семей военнослужащих.

IV. Для реализации религиозных потребностей военнослужащих и членов их семей проводятся следующие мероприятия:
- регулярные посещения священнослужителями военнослужащих (по согласованию с командованием воинских частей) и совершение для них и для членов их семей церковных Таинств и обрядов;
- регулярные богослужения в храмах и молельных комнатах при воинских частях;
- участие военнослужащих в богослужениях, совершаемых в храмах епархии в праздничные дни, в дни поминовения усопших воинов;
- совершение церковных Таинств и обрядов для военнослужащих и членов их семей в храмах епархии.
Работа священнослужителей в воинских частях и учебных заведениях служит обогащению духовной и нравственной жизни воинских коллективов, способствует воспитанию военнослужащих и членов их семей в духе любви к Отечеству, готовности к его защите, развитию милосердия и благотворительности, веротерпимости, гражданской ответственности и патриотизма.